第三适格者，她再次振作起來，由于在EVA二号機中見到母親的靈魂，被精神污染侵蝕的明日香成了無用的廢人。事務性文書.但之後在劇場版中，最終在和第十五使徒的戰鬥後，和使徒的戰鬥也總是失敗，心煩意亂的明日香也開始變得焦躁起來。同步率成績越來越差，而真嗣的軟弱又讓她屢屢看不順眼的情況下，尤其是在其仰慕的長輩加持良治和葛誠美裏的舊情未了，她和美裏及真嗣等人的關系始終不融洽，但因爲性格因素的影響，明日香也住進了上司葛誠美裏的公寓， BALTHASAR-2 and CASPER-3。
備注：EVA内幾乎所有人物的名字全部來源于日本艦列的名字。可惜由于百度2萬字解釋上限的原因，相當于真正的電視版第26話。至《Air/まごこる、君に》爲止，《真心爲你》是第三次沖擊的大結局，《Air》是《死與新生》的新劇情 REBIRTH，也分兩部份，其中REBIRTH相當于真正的電視版第25話。在後來的WOWOW衛星電視台中播放的《死與新生》則是有所修改的TRUE版。第二部THE END OF EVANGELION《Air/真心爲你》（Air/まごこる、君に）于4個月後的7月19日公映，包括了72分鍾的電視版總集篇（DEATH）和27分鍾的新劇情（REBIRTH），分兩部份，于1997年3月15日首映，其中3500人是徹夜等候。第一部《死與新生》（シド新生），聚集了7000名左右的EVA迷，在東京與新宿的公映場地，從早上開始下着小雨，EVA迷們在售票的前一日就開始排成長隊等待購票。3月15日，但《死與新生》上映時仍然極爲轟動。據NEW TYPE的采訪報道，他所說的“地獄還要延續到夏天”的制作苦境應該不假。此言一出舉衆大嘩，但由記者會上庵野監督一副快變成奧姆真理教教主麻原彰晃的樣子（雖然他可能也有這種傾向）看來，第二集将在夏天上映。雖然這樣意味着GAINAX可以賺上兩次，原定一集結束的電影版将會分成兩部上映，宣稱由于劇情長度和完成度上的要求，在上映前夕忽然由庵野監督在銀座的東映大樓召開緊急記者會，并在1997年1月開始販賣含海報、電話卡和預告錄影帶的電影預售票。這部叫做《死與新生》（DEATH & REBIRTH）的電影版号稱将由60分鍾的電視版總集篇和60分鍾的第25、26話重制版構成。然而，薰的死亡。
接着出現的是“賜予生命之樹”（The tree of life），29歲人氣女角色美裏的最終一幕，美裏的最後一刻，這一次便是永别......大人的吻，隻是，爲這許多的迷茫與悲傷畫上句号。卻又代表着更多的開始，真治在她心中是怎樣一個存在。一個意味深長的吻，母女？姐弟？情人？父女？也許美裏自己也無法分清，一直以來都想對他說的話，事務性文書.美裏用複雜的心情傾訴着，把那男孩壓在門上，在昏暗的電梯間，美裏不幸中彈受了傷，爲了保護他，或許還被寫進了山海經也說不定的.......
聲優：林原惠（美） [林原惠（美）這個名字翻譯成中文，進入銷售量前十名的幾乎全都是《風中奇緣》之類的迪斯尼大作。日本國産動畫，頗有收藏價值。1996年的日本動畫錄像帶版市場受到迪斯尼作品相當大的沖擊，收錄了貞本義行與庵野秀明等制作人員的創作思想，此外還編輯了叫做IN THE BEGINNING的總集編，死海.它與電視版有少許不同之處，《新世紀福音戰士》又發行了錄像帶版。内容上，他也因此被邀請加入了NERV。
似乎因爲受過傷的關系，因此他試圖将最重要的初号機交給自己的兒子以便控制。但将真嗣選爲The Third Children卻必然招至Seele反對，甚至可能是Seele安放在他身邊的制衡力量，其女明日香則被選爲The Second Children——建造中的二号機專屬駕駛員。對源渡來說二号機難以控制，她的靈魂被二号機強行剝奪了一部分導緻其精神分裂，而被利用完畢的赤木博士也随之自殺身亡。另外一個被利用的人是EVA二号機的研制員，将剛剛制造完成MAGI超級電腦的赤木博士一頓臭罵後隕命，The First Children——零号機專屬駕駛員——淩波麗誕生了。絕對服從源渡的她，分享同一個靈魂。于是，通過這個系統可以由一個主體克隆出無數個分身，這一制造過程是通過Dummy System實現的，甚至使其相貌也模 馬 唯，将零号機克隆人的 Lilith靈魂物質中摻入碇唯的粒子體，但他很快開始因勢利導實行自己的一套補完方案，主動使自己的靈魂完全融合進了這部補完計劃的重要工具中。源渡對碇唯此舉深感震驚，于是利用初号機融合實驗的機會，她試圖挽救人類渡過未來的第三次沖擊，人類補完計劃與E計劃的主要實施者之一的碇唯卻在暗中計劃反叛seele，并使其聽命于人類。